Снргей родился 28 января 1963 года в селе Хотьково Московской области. После окончания школы поступил в МГУ на факультет журналистики, но, отучившись всего год, ушёл в армию (1981-1983). Окончил университет в 1988 году.

На телевидении Сергей работал с 1980 года. В 1983 году занимал должность администратора в музыкальной редакции ЦТ. Все программы, посвящённые государственным праздникам в 1984 году, были созданы при непосредственном участии Сергея. С 1984 по 1986 год - администратор в отделе пропаганды, с 1986 года начал работать в детской редакции ЦТ и готовил сюжеты для программы "До 16 и старше".

25 января 1988 года состоялся его дебют в качестве ведущего в эфире Центрального телевидения - программа "Марафон 15".

По приглашению Влада Листьева в 1993 году стал вести программу для детей "Звёздный час". В то же самое время Супонев создал концептуально новую передачу для детей "Зов джунглей" и стал её ведущим на многие годы.

Получив за "Зов" премию ТЭФИ (в 1999 году), Сергей передал программу в молодые руки и всерьёз занялся созданием новых проектов для канала ОРТ.

Вскоре детское вещание первого канала запестрело разными по жанру передачами: "Царь горы", "Что да как", "Возможно всё!", "Семь бед - один ответ", "100%", "Седьмое чувство", "Дисней-клуб". Ко всем этим проектам Сергей приложил свою руку, сердце и талант. В последние месяцы он готовил к эфиру ряд совершенно новых программ для юных зрителей...

Трагически погиб 8 декабря 2001 года в Тверской области, катаясь на снегоходе. Похоронен 11 декабря в Москве на Троекуровском кладбище, участок № 4.